ابرکامپیوترهای قدرتمند به جنگ علیه ویروس کرونا پیوستند

از چند روز پیش تابه‌حال درخواست‌های متعددی برای به اشتراک‌گذاری قدرت PC برای نبرد علیه ویروس کرونا ارسال‌شده است و حالا آرنولد ابرکامپیوترها نیز به این نبرد اضافه‌شده است. موسسه تحقیقاتی The Oak Ridge National Laboratory به‌تازگی اعلام کرده است که از ابررایانه‌هایش برای پیدا کردن پروتئینی که می‌تواند ویروس کرونا را متوقف کند استفاده خواهد کرد. به نظر می‌رسد که با جلوگیری از این سنبله‌ها، می‌توان ویروس کرونا را از عفونی کردن سلول‌های ریه متوقف کرد.

ابررایانه Summit دارای 228 هزار هسته پردازشی و همچنین 188,416,000 هسته کودا است. حافظه این رایانه بزرگ نیز 9.2PB است و این قدرت عجیب می‌تواند هر مسئله و مشکلی را به‌راحتی حل کند. مدیر این موسسه گفته است که ابررایانه Summit می‌تواند نتایج شبیه‌سازی‌شده را در یک تا دو روز ارائه دهد و این در حالی است که یک رایانه عادی نیز به ماه‌ها زمان برای انجام این‌گونه محاسبات دارد.

نتایج به‌دست‌آمده به معنی نیستند که حتماً درمان ویروس کرونا پیداشده است اما می‌توانند فوق‌العاده به‌دردبخور باشند و مطالعات در مورد این ویروس را سرعت بخشد. ابررایانه Summit توسط IBM ساخته‌شده است و مقام اول لیست قدرتمندترین ابرکامپیوترها را نیز در دست دارد. استفاده از کارت گرافیک‌های Nvidia Volta GV100 نیز توانسته قدرت شبیه‌سازی این رایانه‌ها را فوق‌العاده افزایش دهد.

اما در مورد دانش شبیه‌ساز پروتئین باید گفت که ویروس 2019-nCoV دارای یک سری پروتئین‌ها روی خود به نام سنبله است که سطح خارجی سلول‌های ریه را درگیر می‌کند و وارد آن‌ها می‌شود. یکی از راه‌ها برای جلوگیری از عفونت این است که پروتئین‌های سطح ویروس را از بین برد و به‌نوعی آن را از کار انداخت. جلوگیری از این پروتئین با استفاده از ترکیب یک پروتئین دیگر با آن امکان‌پذیر است.

پروتئین‌ها اشکال مختلفی دارند و تنها نمونه خاصی با پروتئین روی ویروس واکنش می‌دهد و اینجاست که دانش شبیه‌سازی و ابررایانه‌ها برای پیدا کردن ترکیب مناسب مهم می‌شود. دانشگاه تنسی توانسته مدل پروتئین این ویروس را پیدا کند و از دل آن‌یک مدل محاسباتی بیرون کشیده شده است و محاسبات در حال انجام است. در حال حاضر بیش از 8000 نوع ترکیب پروتئین برای ترکیب با ویروس 2019-nCoV تحت تست هستند.

منبع: TomsHardware